运输战斗机是舰队编组的重要战术环节。迅捷级载机运输船作为游戏内少数具备舰载机搭载能力的运输船，其设计初衷即为解决战斗机远程部署问题。该舰船可搭载轻型战斗机如孢子A404或理智A101，通过前哨站或基地的中转实现跨星系机动。需运输船本身无作战能力，需依赖护航舰队保护，且战斗机在运输状态下无法参与战斗，必须部署至目标区域后才能激活作战模块。
首先是舰船容量限制，每艘迅捷级仅能搭载2-3个战斗机编队，大规模转移需多艘运输船协同作业。其次是燃料消耗问题，战斗机曲率航行需消耗重氢资源，长距离运输需提前规划补给点。舰载机与运输船的适配性也需考量，例如维塔斯A021重型攻击机因体积过大无法通过标准舱门，仅能由特定型号运输船承载。游戏机制明确设定，未搭载于航母的战斗机必须通过运输船实现战略转移。
运输过程中的战术风险主要来自两点。其一是航线暴露，运输船曲率轨迹会被敌方侦察舰捕捉，建议采用蛙跳战术——通过中立空间站分阶段转移。其二是卸载耗时，战斗机从运输状态切换至作战状态需30-120秒不等的整备时间，这个空窗期极易遭受攻击。实测在敌方控制区卸载战斗机的战损率高达67%，因此务必确保制空权后再执行部署。
点出快速部署协议后，战斗机整备时间缩短40%；模块化装配技术则能让运输船搭载量提升至4个编队。部分特殊机型如牛蛙轰炸机自带折叠机翼设计，其运输效率比常规机型提高25%。但技术加成存在上限，运输船始终无法替代专业航母的持续作战能力，其定位应局限于战略投送而非前线支援。
从资源管理角度评估，战斗机运输属于高成本战术行为。单次跨星系转移约消耗800-1500重氢，相当于2-3艘驱逐舰的维护成本。建议优先运输防空型战斗机如孢子A404，其对空664点的火力可有效保护运输舰队。游戏后期可通过建立星门网络降低运输损耗，但需同盟集体完成拉格朗日之门星系态势任务才能解锁该基建。
